Seit 10 Jahren widmet sich das MUSA mit großem Erfolg der Wiener Gegenwartskunst. Die Palette der Ausstellungen reichte von Retrospektiven verdienter Künstler_innen bis zu aufsehenerregenden Darstellungen einzelner Jahrzehnte im Wiener Kunstbetrieb. Auch die beliebte Startgalerie (eine Ausstellungsfläche für junge Künstler_innen) und die Artothek der Stadt, die es möglich macht sich Kunst für zu Hause auszuborgen, haben ihren Standort im MUSA. Bislang war der Ausstellungsort unmittelbar neben dem Rathaus unter der Administration der Kulturabteilung der Stadt Wien (MA7).
Mit 1. Jänner 2018 wird er Teil des Wien Museums. Neben allen Mitarbeiter_innen des MUSA kommt damit auch die Sammlung der Kulturabteilung – über 40.000 im Zuge der städtischen Kunstförderung erworbene Objekte – zum Wien Museum.